La thèse de Thomas Guillemin est consacrée à la biographie intellectuelle d’Isaac Papin (1657-1709), théologien calviniste représentant de l’école de Saumur, converti au catholicisme en 1690 et devenu janséniste. Ses recherches actuelles prolongent le dualisme de son sujet de doctorat, entre histoire de l’école théologique de Saumur et histoire du jansénisme, soit sur des sujets distincts relevant de l’une ou l’autre des confessions envisagées, soit précisément sur des cas (biographiques, d’histoire intellectuelle ou encore d’histoire du livre) où les deux confessions se rencontrent ou se confrontent.