Diversité taxonomique et propriétés symbiotiques des rhizobia nodulant Acacia raddiana au nord et au sud du Sahara

Résumé Fr En

Nous avons étudié une collection de 76 nouveaux isolats bactériens de nodules obtenus par piégeage sur plantes d'Acacia tortilis subsp. raddiana in vitro, inoculées avec des suspensions de sols prélevés dans divers sites au nord (Tunisie) et au sud (Sénégal, Mauritanie) du Sahara, en comparaison avec 54 souches de références. L'analyse des nouveaux isolats par RAPD et SDS-PAGE a montré une grande diversité taxonomique parmi les isolats d'A. tortilis subsp. raddiana. En effet, bien que toutes les souches puissent être qualifiées de « rhizobium à croissance rapide », elles se répartissent en au moins 9 groupes différents, dont plusieurs ne correspondent à aucun des groupes de rhizobia déjà décrits. Aucune relation entre la position taxonomique des souches, leur origine géographique, les conditions édaphiques ou la profondeur d'isolement n'a pu être établie. La caractérisation symbiotique des souches d'A. tortilis subsp. raddiana a, au contraire, montré une grande homogénéité des caractéristiques symbiotiques majeures. Toutes les souches nodulent également A. Senegal, Prosopis julifora et Leucaena leucocephala, qui constituent avec A. tortilis subsp. raddiana un groupe d'inoculation. L'analyse des profils chromatographiques des facteurs Nod (FN) d'une quinzaine de souches réparties dans les différents groupes taxonomiques montre qu'ils sont très similaires. L'homogénéité structurale des FN des souches d'A. tortilis subsp. raddiana a été confirmée par la détermination de la structure des FN de quelques souches représentatives. Cette étroite relation entre FN et plante d'isolement/spectre d'hôte indépendamment de la taxonomie des souches suggère l'existence d'une forte pression de sélection de la part de la plante hôte et confirme nos observations précédentes, à savoir que les facteurs Nod sont de bons indicateurs du potentiel de nodulation d'un rhizobium donné.

We studied a collection of 76 new bacterial isolates from nodules developed on Acacia tortilis subsp. raddiana plants inoculated in vitro with soil suspensions harvested in different sites in North (Tunisia) and South (Senegal, Mauritania) parts of Sahara. RAPD and SDS-PAGE analyses in comparison with 54 reference strains from diverse origins showed great taxonomie diversity among the new isolates. All of them are fast-growing and form at least 9 different groups, several of which could correspond to undescribed groups. No relationship could be established between taxonomie groups, geographical origin (North/South of Sahara) of the strains, edaphic conditions, or depth of soil sampling (down to - 32 m). Opposite to their taxonomie diversity, the new isolates share identical main symbiotic properties. All strains nodulating A. tortilis subsp. raddiana can also nodulate Prosopis juliflora, Acacia Senegal and Leucaena leucocephala, these four plants then constituting a cross-inoculation group. By thin-layer chromatography, we showed that 20 A. tortilis subsp. raddiana strains, representative of the different taxonomie groups, share very similar Nod factor (NF) profiles, independently from their geographical origins. NF structure homogeneity was confirmed by NF structure determination of some representative strains. The consistency between NF and plant of isolation/nodulation spectrum, independently of the taxonomie position of the strains suggests a high selection pressure from the plant, and confirms our previous observations that NF are good markers for predicting the nodulation potential of a given rhizobial strain.