Análisis filogenético de secuencias suramericanas del gen ns1 del serotipo dengue-2, relacionadas con sangrado clínico severo

Résumé 0

"Objetivo Comparar secuencias de nucleótidos y de aminoácidos de la proteína no estructural 1-NS1 de cepas DENV-2, aisladas de pacientes febriles de diferen - tes paises suramericanos, que cursaron cuadros cl ínicos con severidad o sin ella . Materiales y Métodos El análisis filogenético fue realizado a partir de 28 secuen - cias moleculares completas (1 056 pb) del gen NS1 del serotipo DENV-2. Se realizó un análisis filogenético bayesiano utilizando el software MrBayes v.3.2.0, con el mo - delo SYM+G y un análisis filogenético con el método Neighbor-Joining con el mode - lo Jukes-Cantor. Además, las secuencias de aminoácidos fueron alineadas y compa - radas entre sí, mediante el programa Clustal W incluido en el s oftware MEGA v. 5.2. Resultados En las secuencias de aminoácidos asociadas a sangrado, la susti - tución más frecuente fue isoleucina → treonina, en la posición 93. Estas secuen - cias presentaron un mayor porcentaje (94,6 %) de homología de aminoácidos de la proteina NS1 en comparación con el porcentaje de homología (74 %) de los ais - lamientos DENV-2 no asociados a sangrado. Se identificaron cinco clados que agrupan la mayoría de las secuencias analizadas (19/24; 79,2 %) con valores de probabilidad posterior mayores o iguales al 58 %. Siete (87,5 %) secuencias aso - ciadas a sangrado se relacionan filogenéticamente dentro de los clados 4 y 5, con valores de probabilidad posterior del 58 % y 97 %, respectivamente. Conclusion No se encontraron características filogenéticas ni tampoco diferencias entre las secuencias de aminoácidos de la proteína NS1-DENV-2 estudiadas, que pudieran ser relacionadas, de manera directa, con la severidad de la enfermedad."