ALLERGIDOC Ontology Ontologie ALLERGIDOC En Fr

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Date

12 mars 2025

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  • ISIDORE Id:  10670/1.7ae21e...
  • hal:  hal-04610245
  • SWHID: swh:1:dir:d8dabc3bbe02b29104aa55a6eeae3b63d02ab8a2;origin=https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-04610245;visit=swh:1:snp:8cf82a01d8b5ebc4c9fce4bd8f3a6784ccf8c8c4;anchor=swh:1:rel:a7138689d60105858ea139c067956cd6e9ef920b;path=/
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https://doi.org/10.5771/0943-7444-2024-3-151

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Marcin Trzmielewski, « Ontologie ALLERGIDOC », HAL SHS (Sciences de l’Homme et de la Société), ID : 10670/1.7ae21e...


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Résumé En Fr

The ALLERGIDOC Ontology represents scientific, clinical and general knowledge in the domain of allergology. It has been developed by Marcin Trzmielewski for the Allergy Unit of the University Hospital of Montpellier (partners: Doctor Davide Caimmi and Prof. Pascal Demoly), as part of a thesis in information, communication and documentation sciences at the Paul Valéry Montpellier 3 University, funded by the Occitanie Region (France) between 2019 and 2023. The system has been developed using a constructivist approach, based on an analysis of the information practices of employees of the allergology unit and an analysis of the documents that these employees use in their daily lives. To learn more about the aims and methodologies for developing the ontology, consult the thesis at: https://theses.hal.science/tel-04310219 . Version 3.0 includes modifications to versions 1.1 and 2.0 made in February-March 2025 by Marcin Trzmielewski (LERASS), with contributions from students of the professional bachelor in documentation: Anne Guerre, Nada Bouhsina, Sabrina Duc and Claire Cassasso (Université de Montpellier Paul-Valéry). Version 3.0 also contains a new structure at the level of the main classes (facets) and other levels of classificatory depth. The faceted analysis was based on the informational targets of allergology professionals and the Descriptive Ontology for Linguistic and Cognitive Engineering (DOLCE). The concepts, terms and relationships that compose the ontology come from the previous versions 1.1 and 2.0, from the terminological extractions carried out during the development of version 1.0, as well as from the validation meetings of versions 1.0 and 2.0. They also come from existing knowledge organization systems: Ontology for General Medical Science, Information Artifact Ontology, MeSH, SNOMED, ​​LOINC, Allergen Nomenclature, ThermoFisher and Eurofins allergen catalogs, IMAIOS website, biological taxonomies consulted on Wikipedia, Gender, Sex, and Sexual Orientation Ontology, and Eckman classification.

L'ontologie ALLERGIDOC représente les connaissances scientifiques, cliniques et généralistes du domaine de l'allergologie. Elle a été élaborée par Marcin Trzmielewski pour l'Unité d'Exploration des Allergies du CHU de Montpellier (référents : Docteur Davide Caimmi et Prof. Pascal Demoly), dans le cadre d'une thèse en sciences de l'information, de la communication et de la documentation à l'Université Paul Valéry Montpellier 3, financée par la Région Occitanie (France) entre 2019 et 2023. L'ontologie a été élaborée dans une approche constructiviste, à partir d'une analyse des pratiques informationnelles des employés de l'unité d'allergologie et d'une analyse des documents que ces employés utilisent dans leur quotidien. Pour s'informer davantage sur les objectifs et la méthodologies d'élaboration de l'ontologie, consulter la thèse sur : https://theses.hal.science/tel-04310219 . La version 3.0 comprend des modifications des versions 1.1 et 2.0 effectuées en février-mars 2025 par Marcin Trzmielewski (LERASS), avec la contribution des étudiantes de la licence professionnelle en documentation : Anne Guerre, Nada Bouhsina, Sabrina Duc et Claire Casasso (Université de Montpellier Paul-Valéry). La version 3.0 contient également une nouvelle structuration au niveau des classes principales (facettes) et d'autres niveaux de profondeur classificatoire. L'analyse à facettes a été basée sur les cibles informationnelles des professionnels d'allergologie et la Descriptive Ontology for Linguistic and Cognitive Engineering (DOLCE). Les concepts, les termes et les relations qui composent l'ontologie sont issus des versions précédentes 1.1 et 2.0, des extractions terminologiques effectuées lors de l'élaboration de la version 1.0, comme des réunions de validation des versions 1.0 et 2.0. Ils proviennent également des systèmes d'organisation des connaissances existants : Ontology for General Medical Science, Information Artifact Ontology, MeSH, SNOMED, LOINC, Allergen Nomenclature, catalogues des allergènes ThermoFisher et Eurofins, site IMAIOS, taxonomies biologiques consultées sur Wikipédia, Gender, Sex, and Sexual Orientation Ontology, et classification d'Eckman.

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