Un logigramme est toujours utile : application à l’interprétation de l’examen cytobactériologique des urines

Résumé Fr En

L’examen cytobactériologique des urines (ECBU) est l’analyse la plus prescrite dans un laboratoire de microbiologie. Les objectifs du présent travail étaient de présenter notre expérience dans la réalisation de l’ECBU et de partager un des moyens que nous jugeons très utile dans la pratique quotidienne de cette analyse capitale. Il s’agit d’une étude prospective de 28 mois (mars 2016-juin 2018). L’ECBU était réalisé conformément aux recommandations du référentiel en microbiologie médicale (Remic). La sensibilité aux antibiotiques a été étudiée conformément aux recommandations de l’European committee on antimicrobial susceptibility testing (Eucast). Les cultures étaient positives pour infection du tractus urinaire dans 5,09 % (n = 769) des cas et pour colonisation dans 4,88 % (n = 737) des cas. E. coli représentait à elle seule 57,8 % (n = 850) de l’ensemble des isolats. Dans notre expérience, l’affichage du logigramme d’interprétation au niveau de la paillasse ainsi que la disponibilité des renseignements cliniques et des résultats de cytologie au moment du « déblayage » des urocultures, permettent à nos techniciens de décider, de façon autonome, de la conduite à tenir qui s’impose pour chaque ECBU en fonction du contexte particulier du patient pour lequel il a été prescrit. De la même façon, ce logigramme permet au microbiologiste unique du laboratoire d’interpréter contextuellement chaque ECBU.

The cytobacteriological examination of urine (CBEU) is the most prescribed test in a microbiology laboratory. The objectives of this work were to present our experience in carrying out the CBEU and to share one of the means that we consider very useful in the daily practice of this crucial analysis. This is a 28-month prospective study (March 2016 to June 2018). The CBEU was carried out in accordance with the recommendations of the medical microbiology referential (REMIC). Antibiotic susceptibility was studied in accordance with the recommendations of the l’European committee on antimicrobial susceptibility testing (EUCAST). Cultures were positive for urinary tract infection in 5.09% (n=769) of cases and for colonization in 4.88% (n=737) of cases. E. coli alone accounted for 57.8% (n=850) of all isolates. In our experience, the display of the interpretation flowchart at the bench level, as well as the availability of clinical information and cytology results when examining urocultures, allows our technicians to decide, independently, what action to take for each CBEU according to the particular context of the patient for whom it has been prescribed. Similarly, this flowchart allows the unique microbiologist in the laboratory to contextually interpret each CBEU.