Principal component analysis yields results comparable to those of an elaborate Boolean strategy: simplifying the assessment of measurable residual disease in chronic lymphocytic leukemia patients

Résumé En Fr

Introduction: Measurable residual disease (MRD) is becoming increasingly important in the chronic lymphocytic leukemia (CLL) context. It is of independent prognostic significance in terms of favorable progression-free and overall survival. The standardized methods used to assess CLL MRD are based on flow cytometry and real-time quantitative PCR. We here present a nine-color assay for CLL MRD with the ROR-1 marker antigen as recommended by the European Research Initiative (ERIC) on CLL; the sensitivity is at least 10-5. Materials and methods: We used 54 samples to develop a new principal component analysis (PCA) method based on the Kaluza© “radar” presentation mode. We used a Navios flow cytometer (Beckman Coulter©). Results: We confirmed the linearity of our method over more than five dilutions. The specificity limit was 1.3×10-6 and the lower limit of detection was 3.6×10-6. Compared to the Boolean method, the sensitivity, specificity, and positive and negative predictive values of our PCA method were 100%. When MRD was detectable, PCA and Boolean assays were in agreement (linear regression, R2 = 0.99). Conclusion: We developed a new PCA-based method for detection of CLL MRD. Our method is comparable to that of the consensus method in terms of sensitivity, and it is also much easier and faster.

Introduction : La maladie résiduelle détectable (MRD) prend une importance croissante dans la LLC pour sa signification pronostique en termes de survie sans progression et globale. Les méthodes standardisées d’évaluation de la MRD LLC sont basées sur la cytométrie de flux et la RT-qPCR. Nous présentons ici un test à neuf couleurs en ajoutant le marqueur ROR-1, recommandé par l’Initiative européenne de recherche (ERIC) sur la LLC ; la sensibilité est d’au moins 10-5. Matériels et méthodes : Nous avons utilisé 54 échantillons pour développer une nouvelle méthode ­d’analyse en composantes principales (ACP) basée sur le mode de présentation « radar » de Kaluza©. L’acquisition a été réalisée sur un cytomètre en flux Navios (Beckman Coulter©). Résultats : Nous avons confirmé la linéarité de notre méthode et évalué les limites de spécificité (1.3×10-6) et de détection (3.6×10-6). En comparaison avec la méthode booléenne, la sensibilité, la spécificité et les valeurs prédictives positives et négatives de notre méthode ACP étaient de 100 %. Lorsque la MRD était détectable, les tests PCA et Boolean étaient corrélés (r2 = 0,99). Conclusion : Nous présentons ici une nouvelle méthode, facile et rapide basée sur l’ACP pour la détection de la MRD dans la LLC, avec une sensibilité comparable à celle de la méthode consensuelle.