Rapid identification of Escherichia coli colonies from clinical sample inoculated on CHROMagar Orientation media (Becton Dickinson)

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2019

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Eric Farfour et al., « Rapid identification of Escherichia coli colonies from clinical sample inoculated on CHROMagar Orientation media (Becton Dickinson) », Annales de Biologie Clinique, ID : 10670/1.gd4n8f


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Le milieu de culture gélosé chromogénique CHROMagar Orientation (Becton Dickinson) a été développé et validé pour la culture des prélèvements urinaires. Il permet l’identification directe sans tests complémentaires des colonies de E. coli. En raison de sa supériorité par rapport au prélèvement non-chromogénique pour différencier les colonies d’entérobactéries, il est utilisé pour l’ensemencement d’une grande variété de prélèvements par les laboratoires. Mais, l’identification directe des colonies de E. coli n’est pas validée à partir de ces échantillons. En effet, l’écologie microbienne différente selon l’origine des prélèvements et la nature même des échantillons peuvent avoir une incidence sur les performances de la gélose CHROMagar Orientation. Nous avons évalué ce milieu pour l’identification directe des colonies de E. coli à partir de 410 prélèvements non urinaires. La sensibilité évaluée à 99 % permet cette utilisation. La réalisation d’essais sur site à partir d’un nombre élevé d’échantillons représentatifs permet au laboratoire de valider les performances des géloses. Les fournisseurs ayant connaissance de l’utilisation fréquente et non recommandée de leur milieu de culture devraient effectuer des tests et, s’ils sont concluants, adapter leurs instructions techniques.

CHROMmagar Orientation media (Becton Dickinson) was developed and validated for the culture of urinary samples. It allows a direct identification of E. coli colonies without additional tests. As CHROMmagar Orientation media is superior to non-chromogenic media for the distinction of enterobacterial colonies, it is used for the inoculation of a large variety of samples in clinical laboratories. Direct identification of E. coli colonies cultured from these samples is not validated by the manufacturer. The difference in microbial ecology and the nature of the sample may impact CHROMagar Orientation performances for this use. We evaluated these media for the direct identification of E. coli colonies from 410 samples (excluding urine). Its sensitivity of 99% allows a direct identification of E. coli colonies cultured from a wide variety of samples. On-site testing using a large number of representative samples, allows laboratories to assess agar media performance and adapt their uses. Suppliers who are aware of frequent and non-recommended use of their culture media should perform tests and if conclusive, adapt their technical instructions.

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