Du diagnostic préimplantatoire au suivi de troupeau : que peut apporter la génomique aux éleveurs ?

Résumé En Fr

From preimplantation diagnosis to herd monitoring : what does genomics bring to breeders ? Genomic selection is now fully implemented in breeding programs conducted by French breeding companies in Holstein, Normande and Montbeliard breeds. Initially, genotyping has been implemented by companies in selection schemes. This method enables to estimate the genetic potential of an animal at birth, thus shortening considerably the schedule of selection schemes and lowering its cost. In this context, optimizing reproductive biotechnologies has become a strategic priority. This may be achieved through different scenarii combining production of in vivo derived embryos and embryo transfer (ET) and the oocyte retrieval. Nowadays, one of the major challenges for reproductive biotechnologies is the realization of a pre-implantation diagnosis, from a small number of cells taken from the embryo, which opens new perspectives. In addition, since the opening of a genotyping service to French dairy farmers in 2011, genomic selection moved apace in farms from Montbeliard, Holstein, Red Pie and Normande breeds. In farms, genotyping of females is a new management tool enabling to sort heifers from birth, to refine the choice of bulls for an optimized breeding management, to control inbreeding together with genetic level and to anticipate breeding plans (choice of reproduction type and / or use of sexed semen). These tools may help to reach sustainable breeding practices, at collective and individual levels and are expected to evolve with the continuous optimization of genotyping tools.

La sélection génomique est aujourd’hui pleinement appliquée dans les programmes de sélection menés par les entreprises de sélection françaises Prim’Holstein, Normande et Montbéliarde. Dans un premier temps, le génotypage a été principalement valorisé par les entreprises dans la mise en oeuvre des schémas de sélection. Optimiser les techniques de reproduction est devenu un axe stratégique, en combinant la production d’embryons, l’utilisation de la superovulation et du transfert d’embryon (TE), ainsi que la ponction d’ovocytes. Aujourd’hui, un des défis majeurs des biotechnologies de la reproduction est la réalisation d’un diagnostic pré-implantatoire, à partir d’un petit nombre de cellules prélevées chez l’embryon, qui ouvre de nouvelles perspectives. En outre, depuis l’ouverture du service de génotypage aux éleveurs bovins laitiers français en 2011, la sélection génomique s’installe à grands pas au sein des élevages des races Montbéliarde, Prim’Holstein, Pie Rouge et Normande. En élevage, le génotypage des femelles est un nouvel outil de management, facilitant le tri des génisses de renouvellement, permettant d’affiner les accouplements par un choix des taureaux optimisé, de contrôler la consanguinité au niveau génétique et d’anticiper les plans d’accouplement (choix du mode de reproduction et/ ou utilisation de semence sexée). Ces applications doivent permettre d’atteindre des pratiques de reproduction durables, au niveau collectif autant qu’individuel et devraient encore évoluer avec l’amélioration continue des outils de génotypage.