Optimisation des durées d’incubation des milieux de culture en microbiologie

Résumé Fr En

Afin de réaliser les examens de biologie médicale, les laboratoires appliquent les instructions des fournisseurs de réactifs. Pour les milieux de cultures, celles-ci sont souvent incomplètes et peu adaptées à la diversité des prélèvements et des micro-organismes recherchés. Les préconisations du REMIC permettent de pallier ces lacunes. Des délais d’incubations établis en fonction de la nature du prélèvement et du type de micro-organisme recherché sont ainsi proposés. Néanmoins, ils sont le plus souvent exprimés en multiple de 24 heures et sont souvent considérés comme des durées minimales par les laboratoires. Les échantillons étant ensemencés « en continu », alors que les lectures sont effectuées le plus souvent à un moment unique défini de la journée, nous proposons une stratégie visant à optimiser les durées d’incubation des milieux. Une heure de mise en incubation dans la journée dite heure “limite” est définie. À partir de celle-ci les incubations sont arrêtées ou prolongées en fonction des résultats de la culture et de l’examen microscopique notamment. Les instructions des fournisseurs de milieux de culture étant peu adaptées, il apparaît nécessaire que ces fournisseurs s’appuient sur les référentiels des sociétés savantes comme c’est le cas pour les géloses utilisées dans le cadre de la réalisation de l’antibiogramme.

In order to perform biological analysis, clinical laboratories apply the instructions of reagent suppliers. For culture media these instructions are often incomplete and poorly adapted to the variety of clinical samples and micro-organisms. The REMIC can help to overcome these shortcomings. Required time of incubation for culture media are proposed based on the nature of the sample and the type of micro-organism suspected. Nevertheless, they are most often expressed in multiple of 24 hours and they are often considered as minimal by the laboratories. As the samples are inoculated “continuously”, while the readings are most often done at a single definite time of the day, we propose a strategy to optimize incubation duration of cultures medium. A time of incubation in the day so-called “limit” is defined. From this, the incubations are stopped or prolonged according to the results of the culture and the direct examination. As the instructions of suppliers of culture media are not adapted, it appears necessary that these suppliers relies on the repositories of professional societies as this is the case for agars medias used for antibiotic susceptibility testing.