Validación de un marcador microsatélite asociado al gen waxy para la evaluación del contenido de amilosa en accesiones de un banco de germoplasma venezolano
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2012
- handle: 10670/1.mzpinr
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Interciencia
Mots-clés
Multidisciplinarias (Ciencias Sociales) Arroz Gen waxy Microsatélites Oryza sativa L Calidad CulinariaCiter ce document
Erika Arnao et al., « Validación de un marcador microsatélite asociado al gen waxy para la evaluación del contenido de amilosa en accesiones de un banco de germoplasma venezolano », Interciencia, ID : 10670/1.mzpinr
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Résumé
"El contenido de amilosa (CA) es el principal factor determinante de la calidad del grano de arroz cocido. Los arroces son clasificados según su CA sea bajo, intermedio o alto. En la síntesis de amilosa interviene la enzima GBSS, codificada por el gen waxy, ubicado en el cromosoma 6 del arroz. En dicho gen se identificó un microsatélite (SSR) utilizable como marcador molecular para evaluar CA. En este estudio se validó la asociación entre el marcador SSR y CA usando 581 accesiones de arroz de distintos orígenes existentes en el banco de germoplasma de Fundación Danac. Los materiales de arroz fueron sembrados en Calabozo, Guárico, Venezuela, durante los periodos lluvioso y seco, en 2008 y 2009. Se identificaron 11 alelos de entre 100 y 129pb. Cinco de ellos coincidieron con los reportados para los estándares internacionales Pokhareli, Skybonnet, Bengal, Caloro y Lemont. El alelo 1 fue predominante; ~82% de las accesiones con este alelo presentaron CA intermedio. La varianza en el CA explicada por el microsatélite fue baja (49%) comparada con otros estudios, posiblemente por el uso de germoplasma exótico genéticamente más diverso. Los valores del CA variaron para los distintos alelos y no se asoció un alelo a un determinado CA; sin embargo, los alelos 1 y 3 presentaron mayor frecuencia en las accesiones con CA intermedio, y el alelo 2 en accesiones con baja CA. Aunque la explicación dada por el marcador en el CA no fue alta, puede ser útil en etapas tempranas de programas de mejoramiento para producir arroz con calidad culinaria deseable."